Protein–RNA interactions for Protein: H3BMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BMQ9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BMQ9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BMQ9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H3BMQ9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BMQ9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BMQ9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BMQ9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BMQ9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BMQ9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BMQ9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BMQ9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BMQ9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BMQ9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BMQ9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BMQ9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BMQ9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BMQ9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BMQ9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BMQ9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BMQ9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BMQ9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BMQ9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BMQ9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BMQ9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BMQ9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BMQ9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BMQ9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BMQ9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BMQ9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BMQ9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BMQ9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BMQ9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BMQ9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BMQ9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BMQ9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BMQ9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BMQ9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BMQ9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BMQ9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BMQ9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BMQ9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BMQ9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BMQ9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BMQ9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H3BMQ9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H3BMQ9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
H3BMQ9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
H3BMQ9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H3BMQ9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3BMQ9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
H3BMQ9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
H3BMQ9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3BMQ9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3BMQ9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3BMQ9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3BMQ9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
H3BMQ9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3BMQ9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H3BMQ9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H3BMQ9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H3BMQ9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.31■■□□□ 1
H3BMQ9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H3BMQ9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H3BMQ9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
H3BMQ9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H3BMQ9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
H3BMQ9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
H3BMQ9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H3BMQ9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H3BMQ9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H3BMQ9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H3BMQ9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H3BMQ9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
H3BMQ9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H3BMQ9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H3BMQ9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H3BMQ9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H3BMQ9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H3BMQ9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.3■■□□□ 1
H3BMQ9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H3BMQ9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H3BMQ9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H3BMQ9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H3BMQ9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H3BMQ9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H3BMQ9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H3BMQ9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H3BMQ9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H3BMQ9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H3BMQ9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H3BMQ9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
H3BMQ9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H3BMQ9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H3BMQ9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
H3BMQ9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H3BMQ9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H3BMQ9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H3BMQ9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H3BMQ9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H3BMQ9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms