Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU0

FAM187A, Ig-like V-type domain-containing protein FAM187A, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187AA6NFU0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM187AA6NFU0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM187AA6NFU0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM187AA6NFU0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms