Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1350.1 ms