Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C2

EMILIN1, EMILIN-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN1Q9Y6C2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
EMILIN1Q9Y6C2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
EMILIN1Q9Y6C2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
EMILIN1Q9Y6C2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
EMILIN1Q9Y6C2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
EMILIN1Q9Y6C2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
EMILIN1Q9Y6C2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
EMILIN1Q9Y6C2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
EMILIN1Q9Y6C2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
EMILIN1Q9Y6C2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
EMILIN1Q9Y6C2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
EMILIN1Q9Y6C2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
EMILIN1Q9Y6C2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
EMILIN1Q9Y6C2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
EMILIN1Q9Y6C2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
EMILIN1Q9Y6C2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
EMILIN1Q9Y6C2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
EMILIN1Q9Y6C2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
EMILIN1Q9Y6C2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
EMILIN1Q9Y6C2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
EMILIN1Q9Y6C2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
EMILIN1Q9Y6C2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
EMILIN1Q9Y6C2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
EMILIN1Q9Y6C2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
EMILIN1Q9Y6C2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
EMILIN1Q9Y6C2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
EMILIN1Q9Y6C2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
EMILIN1Q9Y6C2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
EMILIN1Q9Y6C2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
EMILIN1Q9Y6C2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
EMILIN1Q9Y6C2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
EMILIN1Q9Y6C2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
EMILIN1Q9Y6C2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms