Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PCDHB6Q9Y5E3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHB6Q9Y5E3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms