Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCTD3Q9Y597 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCTD3Q9Y597 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCTD3Q9Y597 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCTD3Q9Y597 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCTD3Q9Y597 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KCTD3Q9Y597 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCTD3Q9Y597 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCTD3Q9Y597 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCTD3Q9Y597 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCTD3Q9Y597 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCTD3Q9Y597 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCTD3Q9Y597 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCTD3Q9Y597 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCTD3Q9Y597 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCTD3Q9Y597 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCTD3Q9Y597 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCTD3Q9Y597 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCTD3Q9Y597 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCTD3Q9Y597 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCTD3Q9Y597 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCTD3Q9Y597 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCTD3Q9Y597 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCTD3Q9Y597 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCTD3Q9Y597 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCTD3Q9Y597 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCTD3Q9Y597 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCTD3Q9Y597 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCTD3Q9Y597 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCTD3Q9Y597 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCTD3Q9Y597 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms