Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP8A1Q9Y2Q0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms