Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2B5

VPS9D1, VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1Q9Y2B5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS9D1Q9Y2B5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS9D1Q9Y2B5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS9D1Q9Y2B5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VPS9D1Q9Y2B5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS9D1Q9Y2B5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms