Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PNMA2Q9UL42 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PNMA2Q9UL42 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PNMA2Q9UL42 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms