Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C4Q9UKN8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GTF3C4Q9UKN8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF3C4Q9UKN8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF3C4Q9UKN8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF3C4Q9UKN8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF3C4Q9UKN8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF3C4Q9UKN8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF3C4Q9UKN8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF3C4Q9UKN8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF3C4Q9UKN8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF3C4Q9UKN8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF3C4Q9UKN8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF3C4Q9UKN8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF3C4Q9UKN8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF3C4Q9UKN8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF3C4Q9UKN8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF3C4Q9UKN8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF3C4Q9UKN8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF3C4Q9UKN8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF3C4Q9UKN8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF3C4Q9UKN8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF3C4Q9UKN8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF3C4Q9UKN8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF3C4Q9UKN8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C4Q9UKN8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C4Q9UKN8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C4Q9UKN8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C4Q9UKN8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms