Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
TNIKQ9UKE5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
TNIKQ9UKE5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
TNIKQ9UKE5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
TNIKQ9UKE5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
TNIKQ9UKE5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.88
TNIKQ9UKE5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC39.32■■■■□ 3.88
TNIKQ9UKE5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.88
TNIKQ9UKE5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
TNIKQ9UKE5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
TNIKQ9UKE5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
TNIKQ9UKE5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
TNIKQ9UKE5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
TNIKQ9UKE5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
TNIKQ9UKE5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
TNIKQ9UKE5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
TNIKQ9UKE5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
TNIKQ9UKE5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
TNIKQ9UKE5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
TNIKQ9UKE5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
TNIKQ9UKE5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
TNIKQ9UKE5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
TNIKQ9UKE5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
TNIKQ9UKE5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
TNIKQ9UKE5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
TNIKQ9UKE5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
TNIKQ9UKE5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
TNIKQ9UKE5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
TNIKQ9UKE5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
TNIKQ9UKE5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
TNIKQ9UKE5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
TNIKQ9UKE5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
TNIKQ9UKE5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
TNIKQ9UKE5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
TNIKQ9UKE5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
TNIKQ9UKE5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC39.26■■■■□ 3.87
TNIKQ9UKE5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
TNIKQ9UKE5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
TNIKQ9UKE5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
TNIKQ9UKE5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
TNIKQ9UKE5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
TNIKQ9UKE5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
TNIKQ9UKE5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
TNIKQ9UKE5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
TNIKQ9UKE5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
TNIKQ9UKE5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
TNIKQ9UKE5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
TNIKQ9UKE5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
TNIKQ9UKE5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
TNIKQ9UKE5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC39.22■■■■□ 3.87
TNIKQ9UKE5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
TNIKQ9UKE5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
TNIKQ9UKE5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
TNIKQ9UKE5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
TNIKQ9UKE5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
TNIKQ9UKE5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
TNIKQ9UKE5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
TNIKQ9UKE5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
TNIKQ9UKE5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
TNIKQ9UKE5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
TNIKQ9UKE5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
TNIKQ9UKE5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
TNIKQ9UKE5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
TNIKQ9UKE5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
TNIKQ9UKE5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
TNIKQ9UKE5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
TNIKQ9UKE5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
TNIKQ9UKE5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
TNIKQ9UKE5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
TNIKQ9UKE5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
TNIKQ9UKE5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
TNIKQ9UKE5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
TNIKQ9UKE5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC39.14■■■■□ 3.86
TNIKQ9UKE5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
TNIKQ9UKE5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
TNIKQ9UKE5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC39.13■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.13■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC39.1■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
TNIKQ9UKE5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms