Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK45

LSM7, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM7Q9UK45 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LSM7Q9UK45 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LSM7Q9UK45 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSM7Q9UK45 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.2 ms