Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFF4Q9UHB7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
AFF4Q9UHB7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFF4Q9UHB7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
AFF4Q9UHB7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFF4Q9UHB7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFF4Q9UHB7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFF4Q9UHB7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFF4Q9UHB7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFF4Q9UHB7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFF4Q9UHB7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFF4Q9UHB7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFF4Q9UHB7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
AFF4Q9UHB7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
AFF4Q9UHB7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFF4Q9UHB7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFF4Q9UHB7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFF4Q9UHB7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFF4Q9UHB7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFF4Q9UHB7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFF4Q9UHB7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFF4Q9UHB7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFF4Q9UHB7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFF4Q9UHB7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.6 ms