Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DKK3Q9UBP4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DKK3Q9UBP4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DKK3Q9UBP4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DKK3Q9UBP4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DKK3Q9UBP4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DKK3Q9UBP4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DKK3Q9UBP4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DKK3Q9UBP4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DKK3Q9UBP4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DKK3Q9UBP4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DKK3Q9UBP4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DKK3Q9UBP4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DKK3Q9UBP4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DKK3Q9UBP4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DKK3Q9UBP4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DKK3Q9UBP4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DKK3Q9UBP4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DKK3Q9UBP4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DKK3Q9UBP4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DKK3Q9UBP4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DKK3Q9UBP4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DKK3Q9UBP4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DKK3Q9UBP4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DKK3Q9UBP4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms