Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABI3Q9P2A4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ABI3Q9P2A4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ABI3Q9P2A4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABI3Q9P2A4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABI3Q9P2A4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms