Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX43Q9NXZ2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DDX43Q9NXZ2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms