Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDAP2Q9NXN4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDAP2Q9NXN4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GDAP2Q9NXN4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDAP2Q9NXN4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms