Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CNTLNQ9NXG0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CNTLNQ9NXG0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
CNTLNQ9NXG0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CNTLNQ9NXG0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CNTLNQ9NXG0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CNTLNQ9NXG0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
CNTLNQ9NXG0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
CNTLNQ9NXG0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CNTLNQ9NXG0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CNTLNQ9NXG0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CNTLNQ9NXG0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CNTLNQ9NXG0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CNTLNQ9NXG0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CNTLNQ9NXG0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CNTLNQ9NXG0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CNTLNQ9NXG0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CNTLNQ9NXG0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CNTLNQ9NXG0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CNTLNQ9NXG0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CNTLNQ9NXG0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CNTLNQ9NXG0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CNTLNQ9NXG0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CNTLNQ9NXG0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CNTLNQ9NXG0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CNTLNQ9NXG0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CNTLNQ9NXG0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CNTLNQ9NXG0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
CNTLNQ9NXG0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CNTLNQ9NXG0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CNTLNQ9NXG0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CNTLNQ9NXG0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CNTLNQ9NXG0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CNTLNQ9NXG0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CNTLNQ9NXG0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CNTLNQ9NXG0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CNTLNQ9NXG0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
CNTLNQ9NXG0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CNTLNQ9NXG0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
CNTLNQ9NXG0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
CNTLNQ9NXG0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CNTLNQ9NXG0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
CNTLNQ9NXG0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CNTLNQ9NXG0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CNTLNQ9NXG0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
CNTLNQ9NXG0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CNTLNQ9NXG0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CNTLNQ9NXG0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CNTLNQ9NXG0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
CNTLNQ9NXG0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CNTLNQ9NXG0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
CNTLNQ9NXG0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CNTLNQ9NXG0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CNTLNQ9NXG0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CNTLNQ9NXG0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CNTLNQ9NXG0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CNTLNQ9NXG0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CNTLNQ9NXG0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CNTLNQ9NXG0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CNTLNQ9NXG0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CNTLNQ9NXG0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CNTLNQ9NXG0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CNTLNQ9NXG0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CNTLNQ9NXG0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CNTLNQ9NXG0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CNTLNQ9NXG0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CNTLNQ9NXG0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CNTLNQ9NXG0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms