Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDHAF2Q9NX18 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDHAF2Q9NX18 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms