Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWY4

HPF1, Histone PARylation factor 1, humanhuman

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPF1Q9NWY4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HPF1Q9NWY4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HPF1Q9NWY4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPF1Q9NWY4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPF1Q9NWY4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HPF1Q9NWY4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPF1Q9NWY4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HPF1Q9NWY4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPF1Q9NWY4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HPF1Q9NWY4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPF1Q9NWY4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPF1Q9NWY4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPF1Q9NWY4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPF1Q9NWY4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPF1Q9NWY4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPF1Q9NWY4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPF1Q9NWY4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPF1Q9NWY4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPF1Q9NWY4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPF1Q9NWY4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HPF1Q9NWY4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPF1Q9NWY4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPF1Q9NWY4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPF1Q9NWY4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPF1Q9NWY4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPF1Q9NWY4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPF1Q9NWY4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPF1Q9NWY4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPF1Q9NWY4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPF1Q9NWY4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPF1Q9NWY4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPF1Q9NWY4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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