Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARD6AQ9NPB6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PARD6AQ9NPB6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARD6AQ9NPB6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARD6AQ9NPB6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARD6AQ9NPB6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARD6AQ9NPB6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARD6AQ9NPB6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARD6AQ9NPB6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARD6AQ9NPB6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARD6AQ9NPB6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARD6AQ9NPB6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARD6AQ9NPB6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARD6AQ9NPB6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PARD6AQ9NPB6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARD6AQ9NPB6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARD6AQ9NPB6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARD6AQ9NPB6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARD6AQ9NPB6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARD6AQ9NPB6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARD6AQ9NPB6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARD6AQ9NPB6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARD6AQ9NPB6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARD6AQ9NPB6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARD6AQ9NPB6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARD6AQ9NPB6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARD6AQ9NPB6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARD6AQ9NPB6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PARD6AQ9NPB6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PARD6AQ9NPB6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PARD6AQ9NPB6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARD6AQ9NPB6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms