Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP08

HMX1, Homeobox protein HMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX1Q9NP08 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HMX1Q9NP08 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HMX1Q9NP08 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HMX1Q9NP08 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HMX1Q9NP08 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HMX1Q9NP08 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HMX1Q9NP08 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HMX1Q9NP08 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HMX1Q9NP08 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HMX1Q9NP08 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HMX1Q9NP08 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HMX1Q9NP08 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HMX1Q9NP08 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HMX1Q9NP08 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HMX1Q9NP08 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HMX1Q9NP08 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HMX1Q9NP08 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HMX1Q9NP08 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HMX1Q9NP08 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HMX1Q9NP08 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HMX1Q9NP08 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HMX1Q9NP08 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HMX1Q9NP08 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HMX1Q9NP08 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HMX1Q9NP08 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HMX1Q9NP08 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HMX1Q9NP08 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HMX1Q9NP08 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HMX1Q9NP08 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HMX1Q9NP08 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HMX1Q9NP08 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HMX1Q9NP08 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HMX1Q9NP08 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HMX1Q9NP08 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HMX1Q9NP08 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HMX1Q9NP08 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HMX1Q9NP08 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HMX1Q9NP08 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HMX1Q9NP08 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HMX1Q9NP08 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HMX1Q9NP08 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HMX1Q9NP08 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HMX1Q9NP08 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HMX1Q9NP08 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HMX1Q9NP08 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HMX1Q9NP08 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
HMX1Q9NP08 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HMX1Q9NP08 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HMX1Q9NP08 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HMX1Q9NP08 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HMX1Q9NP08 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HMX1Q9NP08 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HMX1Q9NP08 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HMX1Q9NP08 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMX1Q9NP08 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMX1Q9NP08 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMX1Q9NP08 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HMX1Q9NP08 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMX1Q9NP08 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMX1Q9NP08 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMX1Q9NP08 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HMX1Q9NP08 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HMX1Q9NP08 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HMX1Q9NP08 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms