Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8W5

TRIM45, Tripartite motif-containing protein 45, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM45Q9H8W5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM45Q9H8W5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM45Q9H8W5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms