Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPAP3Q9H6T3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPAP3Q9H6T3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP3Q9H6T3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP3Q9H6T3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP3Q9H6T3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP3Q9H6T3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP3Q9H6T3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP3Q9H6T3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPAP3Q9H6T3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPAP3Q9H6T3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPAP3Q9H6T3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPAP3Q9H6T3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPAP3Q9H6T3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPAP3Q9H6T3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPAP3Q9H6T3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPAP3Q9H6T3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPAP3Q9H6T3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPAP3Q9H6T3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPAP3Q9H6T3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPAP3Q9H6T3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPAP3Q9H6T3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPAP3Q9H6T3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPAP3Q9H6T3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RPAP3Q9H6T3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPAP3Q9H6T3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPAP3Q9H6T3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPAP3Q9H6T3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPAP3Q9H6T3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPAP3Q9H6T3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPAP3Q9H6T3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPAP3Q9H6T3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 339.3 ms