Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL6

PRKD2, Serine/threonine-protein kinase D2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2Q9BZL6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKD2Q9BZL6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKD2Q9BZL6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKD2Q9BZL6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms