Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GSDMCQ9BYG8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSDMCQ9BYG8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms