Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF3

CECR2, Cat eye syndrome critical region protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CECR2Q9BXF3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.58■■■■■ 4.73
CECR2Q9BXF3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.58■■■■■ 4.73
CECR2Q9BXF3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.58■■■■■ 4.73
CECR2Q9BXF3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC44.58■■■■■ 4.73
CECR2Q9BXF3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC44.58■■■■■ 4.73
CECR2Q9BXF3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
CECR2Q9BXF3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
CECR2Q9BXF3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
CECR2Q9BXF3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.55■■■■■ 4.72
CECR2Q9BXF3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
CECR2Q9BXF3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
CECR2Q9BXF3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
CECR2Q9BXF3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
CECR2Q9BXF3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC44.53■■■■■ 4.72
CECR2Q9BXF3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC44.53■■■■■ 4.72
CECR2Q9BXF3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC44.53■■■■■ 4.72
CECR2Q9BXF3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC44.53■■■■■ 4.72
CECR2Q9BXF3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC44.53■■■■■ 4.72
CECR2Q9BXF3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
CECR2Q9BXF3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC44.52■■■■■ 4.72
CECR2Q9BXF3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
CECR2Q9BXF3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
CECR2Q9BXF3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC44.51■■■■■ 4.72
CECR2Q9BXF3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.51■■■■■ 4.72
CECR2Q9BXF3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
CECR2Q9BXF3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC44.49■■■■■ 4.71
CECR2Q9BXF3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC44.48■■■■■ 4.71
CECR2Q9BXF3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
CECR2Q9BXF3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
CECR2Q9BXF3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
CECR2Q9BXF3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
CECR2Q9BXF3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
CECR2Q9BXF3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
CECR2Q9BXF3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
CECR2Q9BXF3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
CECR2Q9BXF3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
CECR2Q9BXF3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
CECR2Q9BXF3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC44.45■■■■■ 4.71
CECR2Q9BXF3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC44.45■■■■■ 4.71
CECR2Q9BXF3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC44.45■■■■■ 4.71
CECR2Q9BXF3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
CECR2Q9BXF3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.44■■■■■ 4.71
CECR2Q9BXF3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC44.44■■■■■ 4.7
CECR2Q9BXF3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC44.44■■■■■ 4.7
CECR2Q9BXF3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC44.43■■■■■ 4.7
CECR2Q9BXF3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.42■■■■■ 4.7
CECR2Q9BXF3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
CECR2Q9BXF3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
CECR2Q9BXF3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC44.42■■■■■ 4.7
CECR2Q9BXF3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
CECR2Q9BXF3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC44.4■■■■■ 4.7
CECR2Q9BXF3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC44.4■■■■■ 4.7
CECR2Q9BXF3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
CECR2Q9BXF3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
CECR2Q9BXF3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
CECR2Q9BXF3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
CECR2Q9BXF3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
CECR2Q9BXF3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
CECR2Q9BXF3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.39■■■■■ 4.7
CECR2Q9BXF3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
CECR2Q9BXF3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
CECR2Q9BXF3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
CECR2Q9BXF3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC44.38■■■■■ 4.69
CECR2Q9BXF3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
CECR2Q9BXF3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC44.37■■■■■ 4.69
CECR2Q9BXF3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC44.37■■■■■ 4.69
CECR2Q9BXF3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
CECR2Q9BXF3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
CECR2Q9BXF3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
CECR2Q9BXF3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
CECR2Q9BXF3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC44.35■■■■■ 4.69
CECR2Q9BXF3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
CECR2Q9BXF3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
CECR2Q9BXF3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC44.34■■■■■ 4.69
CECR2Q9BXF3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
CECR2Q9BXF3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.33■■■■■ 4.69
CECR2Q9BXF3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
CECR2Q9BXF3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
CECR2Q9BXF3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC44.33■■■■■ 4.69
CECR2Q9BXF3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC44.33■■■■■ 4.69
CECR2Q9BXF3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.32■■■■■ 4.69
CECR2Q9BXF3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC44.32■■■■■ 4.69
CECR2Q9BXF3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC44.32■■■■■ 4.69
CECR2Q9BXF3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
CECR2Q9BXF3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
CECR2Q9BXF3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC44.31■■■■■ 4.68
CECR2Q9BXF3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC44.31■■■■■ 4.68
CECR2Q9BXF3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
CECR2Q9BXF3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
CECR2Q9BXF3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC44.3■■■■■ 4.68
CECR2Q9BXF3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC44.3■■■■■ 4.68
CECR2Q9BXF3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
CECR2Q9BXF3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
CECR2Q9BXF3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC44.28■■■■■ 4.68
CECR2Q9BXF3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.28■■■■■ 4.68
CECR2Q9BXF3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC44.28■■■■■ 4.68
CECR2Q9BXF3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC44.28■■■■■ 4.68
CECR2Q9BXF3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.28■■■■■ 4.68
CECR2Q9BXF3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.28■■■■■ 4.68
CECR2Q9BXF3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms