Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC2P3Q9BVR0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC2P3Q9BVR0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERC2P3Q9BVR0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms