Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLF1Q9BQI6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLF1Q9BQI6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLF1Q9BQI6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms