Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
SGIP1Q9BQI5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SGIP1Q9BQI5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SGIP1Q9BQI5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SGIP1Q9BQI5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SGIP1Q9BQI5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SGIP1Q9BQI5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SGIP1Q9BQI5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SGIP1Q9BQI5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SGIP1Q9BQI5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SGIP1Q9BQI5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SGIP1Q9BQI5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SGIP1Q9BQI5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SGIP1Q9BQI5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SGIP1Q9BQI5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SGIP1Q9BQI5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SGIP1Q9BQI5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SGIP1Q9BQI5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SGIP1Q9BQI5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SGIP1Q9BQI5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SGIP1Q9BQI5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SGIP1Q9BQI5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SGIP1Q9BQI5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SGIP1Q9BQI5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SGIP1Q9BQI5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SGIP1Q9BQI5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SGIP1Q9BQI5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SGIP1Q9BQI5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SGIP1Q9BQI5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SGIP1Q9BQI5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SGIP1Q9BQI5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SGIP1Q9BQI5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SGIP1Q9BQI5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SGIP1Q9BQI5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SGIP1Q9BQI5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SGIP1Q9BQI5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SGIP1Q9BQI5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SGIP1Q9BQI5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SGIP1Q9BQI5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SGIP1Q9BQI5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SGIP1Q9BQI5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SGIP1Q9BQI5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SGIP1Q9BQI5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SGIP1Q9BQI5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.6 ms