Protein–RNA interactions for Protein: Q96T68

SETDB2, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB2, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETDB2Q96T68 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SETDB2Q96T68 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SETDB2Q96T68 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SETDB2Q96T68 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SETDB2Q96T68 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SETDB2Q96T68 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SETDB2Q96T68 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SETDB2Q96T68 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SETDB2Q96T68 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SETDB2Q96T68 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SETDB2Q96T68 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SETDB2Q96T68 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SETDB2Q96T68 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SETDB2Q96T68 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SETDB2Q96T68 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SETDB2Q96T68 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SETDB2Q96T68 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SETDB2Q96T68 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SETDB2Q96T68 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SETDB2Q96T68 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SETDB2Q96T68 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SETDB2Q96T68 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SETDB2Q96T68 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SETDB2Q96T68 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SETDB2Q96T68 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SETDB2Q96T68 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SETDB2Q96T68 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SETDB2Q96T68 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SETDB2Q96T68 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SETDB2Q96T68 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SETDB2Q96T68 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SETDB2Q96T68 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SETDB2Q96T68 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SETDB2Q96T68 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SETDB2Q96T68 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SETDB2Q96T68 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SETDB2Q96T68 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SETDB2Q96T68 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SETDB2Q96T68 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SETDB2Q96T68 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SETDB2Q96T68 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SETDB2Q96T68 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SETDB2Q96T68 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SETDB2Q96T68 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SETDB2Q96T68 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SETDB2Q96T68 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SETDB2Q96T68 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SETDB2Q96T68 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
SETDB2Q96T68 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SETDB2Q96T68 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SETDB2Q96T68 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms