Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NUDCD1Q96RS6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUDCD1Q96RS6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NUDCD1Q96RS6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms