Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C8orf48Q96LL4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C8orf48Q96LL4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C8orf48Q96LL4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C8orf48Q96LL4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C8orf48Q96LL4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C8orf48Q96LL4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
C8orf48Q96LL4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
C8orf48Q96LL4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C8orf48Q96LL4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C8orf48Q96LL4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C8orf48Q96LL4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C8orf48Q96LL4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C8orf48Q96LL4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C8orf48Q96LL4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C8orf48Q96LL4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C8orf48Q96LL4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C8orf48Q96LL4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C8orf48Q96LL4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C8orf48Q96LL4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C8orf48Q96LL4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C8orf48Q96LL4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C8orf48Q96LL4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C8orf48Q96LL4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C8orf48Q96LL4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C8orf48Q96LL4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C8orf48Q96LL4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C8orf48Q96LL4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C8orf48Q96LL4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
C8orf48Q96LL4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C8orf48Q96LL4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C8orf48Q96LL4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C8orf48Q96LL4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.8 ms