Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELP4Q96EB1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms