Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTP4Q969X6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
UTP4Q969X6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UTP4Q969X6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms