Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS9Q8WXC6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPS9Q8WXC6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS9Q8WXC6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms