Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF5

ZNRF4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF4Q8WWF5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNRF4Q8WWF5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ZNRF4Q8WWF5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNRF4Q8WWF5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms