Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC107Q8WV48 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC107Q8WV48 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms