Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BEST2Q8NFU1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BEST2Q8NFU1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 764.5 ms