Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC197Q8NCU1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC197Q8NCU1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.5 ms