Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LINC00301Q8NCQ3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LINC00301Q8NCQ3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LINC00301Q8NCQ3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LINC00301Q8NCQ3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LINC00301Q8NCQ3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LINC00301Q8NCQ3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LINC00301Q8NCQ3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LINC00301Q8NCQ3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LINC00301Q8NCQ3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LINC00301Q8NCQ3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LINC00301Q8NCQ3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LINC00301Q8NCQ3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LINC00301Q8NCQ3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LINC00301Q8NCQ3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LINC00301Q8NCQ3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LINC00301Q8NCQ3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LINC00301Q8NCQ3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LINC00301Q8NCQ3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LINC00301Q8NCQ3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LINC00301Q8NCQ3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LINC00301Q8NCQ3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LINC00301Q8NCQ3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LINC00301Q8NCQ3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LINC00301Q8NCQ3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LINC00301Q8NCQ3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LINC00301Q8NCQ3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LINC00301Q8NCQ3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LINC00301Q8NCQ3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LINC00301Q8NCQ3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LINC00301Q8NCQ3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LINC00301Q8NCQ3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LINC00301Q8NCQ3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms