Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPRYD3Q8NCJ5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPRYD3Q8NCJ5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPRYD3Q8NCJ5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPRYD3Q8NCJ5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SPRYD3Q8NCJ5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SPRYD3Q8NCJ5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPRYD3Q8NCJ5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPRYD3Q8NCJ5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPRYD3Q8NCJ5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms