Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HACE1Q8IYU2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HACE1Q8IYU2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HACE1Q8IYU2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms