Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS2

CCDC65, Coiled-coil domain-containing protein 65, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC65Q8IXS2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC65Q8IXS2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC65Q8IXS2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC65Q8IXS2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC65Q8IXS2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC65Q8IXS2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC65Q8IXS2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC65Q8IXS2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC65Q8IXS2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC65Q8IXS2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC65Q8IXS2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC65Q8IXS2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC65Q8IXS2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC65Q8IXS2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC65Q8IXS2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC65Q8IXS2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC65Q8IXS2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC65Q8IXS2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC65Q8IXS2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC65Q8IXS2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC65Q8IXS2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC65Q8IXS2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC65Q8IXS2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC65Q8IXS2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC65Q8IXS2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC65Q8IXS2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC65Q8IXS2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC65Q8IXS2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC65Q8IXS2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC65Q8IXS2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC65Q8IXS2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC65Q8IXS2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC65Q8IXS2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC65Q8IXS2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC65Q8IXS2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC65Q8IXS2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC65Q8IXS2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC65Q8IXS2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC65Q8IXS2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC65Q8IXS2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC65Q8IXS2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC65Q8IXS2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC65Q8IXS2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC65Q8IXS2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC65Q8IXS2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC65Q8IXS2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC65Q8IXS2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC65Q8IXS2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC65Q8IXS2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC65Q8IXS2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC65Q8IXS2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC65Q8IXS2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC65Q8IXS2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC65Q8IXS2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC65Q8IXS2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC65Q8IXS2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC65Q8IXS2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC65Q8IXS2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC65Q8IXS2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC65Q8IXS2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms