Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWL1

SFTPA2, Pulmonary surfactant-associated protein A2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPA2Q8IWL1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFTPA2Q8IWL1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFTPA2Q8IWL1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFTPA2Q8IWL1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFTPA2Q8IWL1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFTPA2Q8IWL1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms