Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5L2

R3HCC1L, Coiled-coil domain-containing protein R3HCC1L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1LQ7Z5L2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
R3HCC1LQ7Z5L2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
R3HCC1LQ7Z5L2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms