Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
STRCQ7RTU9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
STRCQ7RTU9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
STRCQ7RTU9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
STRCQ7RTU9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
STRCQ7RTU9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
STRCQ7RTU9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
STRCQ7RTU9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
STRCQ7RTU9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
STRCQ7RTU9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
STRCQ7RTU9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
STRCQ7RTU9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
STRCQ7RTU9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
STRCQ7RTU9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
STRCQ7RTU9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
STRCQ7RTU9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
STRCQ7RTU9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
STRCQ7RTU9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
STRCQ7RTU9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
STRCQ7RTU9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
STRCQ7RTU9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC34.82■■■■□ 3.17
STRCQ7RTU9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.17
STRCQ7RTU9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC34.82■■■■□ 3.17
STRCQ7RTU9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
STRCQ7RTU9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
STRCQ7RTU9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
STRCQ7RTU9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
STRCQ7RTU9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
STRCQ7RTU9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
STRCQ7RTU9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
STRCQ7RTU9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
STRCQ7RTU9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
STRCQ7RTU9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
STRCQ7RTU9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
STRCQ7RTU9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
STRCQ7RTU9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
STRCQ7RTU9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
STRCQ7RTU9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
STRCQ7RTU9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
STRCQ7RTU9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
STRCQ7RTU9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
STRCQ7RTU9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
STRCQ7RTU9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
STRCQ7RTU9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
STRCQ7RTU9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
STRCQ7RTU9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
STRCQ7RTU9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
STRCQ7RTU9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
STRCQ7RTU9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
STRCQ7RTU9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
STRCQ7RTU9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
STRCQ7RTU9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
STRCQ7RTU9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
STRCQ7RTU9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
STRCQ7RTU9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
STRCQ7RTU9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
STRCQ7RTU9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
STRCQ7RTU9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
STRCQ7RTU9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
STRCQ7RTU9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
STRCQ7RTU9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
STRCQ7RTU9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
STRCQ7RTU9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
STRCQ7RTU9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
STRCQ7RTU9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
STRCQ7RTU9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
STRCQ7RTU9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
STRCQ7RTU9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
STRCQ7RTU9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
STRCQ7RTU9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
STRCQ7RTU9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
STRCQ7RTU9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
STRCQ7RTU9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
STRCQ7RTU9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
STRCQ7RTU9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
STRCQ7RTU9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
STRCQ7RTU9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
STRCQ7RTU9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
STRCQ7RTU9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
STRCQ7RTU9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
STRCQ7RTU9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
STRCQ7RTU9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
STRCQ7RTU9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
STRCQ7RTU9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
STRCQ7RTU9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
STRCQ7RTU9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
STRCQ7RTU9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
STRCQ7RTU9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC34.66■■■■□ 3.14
STRCQ7RTU9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
STRCQ7RTU9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
STRCQ7RTU9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
STRCQ7RTU9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
STRCQ7RTU9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
STRCQ7RTU9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
STRCQ7RTU9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
STRCQ7RTU9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
STRCQ7RTU9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
STRCQ7RTU9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
STRCQ7RTU9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
STRCQ7RTU9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms