Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H2AFVQ71UI9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2AFVQ71UI9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
H2AFVQ71UI9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H2AFVQ71UI9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H2AFVQ71UI9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H2AFVQ71UI9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H2AFVQ71UI9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms