Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSG1

RNF165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF165Q6ZSG1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF165Q6ZSG1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF165Q6ZSG1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms