Protein–RNA interactions for Protein: Q6QAJ8

TMEM220, Transmembrane protein 220, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM220Q6QAJ8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM220Q6QAJ8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM220Q6QAJ8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM220Q6QAJ8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM220Q6QAJ8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM220Q6QAJ8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM220Q6QAJ8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM220Q6QAJ8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM220Q6QAJ8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM220Q6QAJ8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM220Q6QAJ8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM220Q6QAJ8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM220Q6QAJ8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms